| 科名 | 種名 |
|---|---|
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動物界
鳥綱 （一） みずなぎどり目 |
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| あほうどり科 | ディオメデア・アルバトルス（アホウドリ） |
| （二） ペリカン目 | |
| う科 | ファラクロコラクス・ウリレ（チシマウガラス） |
| （三） こうのとり目 | |
| こうのとり科 | キコニア・ボイキアナ（異名キコニア・キコニア・ボイキアナ。コウノトリ） |
| とき科 | ニポニア・ニポン（トキ） |
| （四） がんかも目 | |
| がんかも科 | ブランタ・カナデンスィス・レウコパレイア（シジュウカラガン） |
| （五） わしたか目 | |
| わしたか科 |
アキピテル・ゲンティリス・フジヤマエ（オオタカ）
アクイラ・クリュサエトス・ヤポニカ（イヌワシ） ブテオ・ブテオ・オスィロイ（ダイトウノスリ） ブテオ・ブテオ・トヨスィマイ（オガサワラノスリ） ハリアエエトゥス・アルビキルラ・アルビキルラ（オジロワシ） ハリアエエトゥス・ペラギクス・ペラギクス（オオワシ） スピロルニス・ケエラ・ペルプレクスス（カンムリワシ） スピザエトゥス・ニパレンスィス・オリエンタリス（クマタカ） |
| （六） きじ目 | |
| きじ科 | ラゴプス・ムトゥス・ヤポニクス（ライチョウ） |
| （七） つる目 | |
| つる科 | グルス・ヤポネンスィス（タンチョウ） |
| くいな科 | ラルルス・オキナワエ(ヤンバルクイナ) |
| （八） ちどり目 | |
| しぎ科 |
スコロパクス・ミラ（アマミヤマシギ）
トリンガ・グティフェル（カラフトアオアシシギ） |
| うみすずめ科 |
ルンダ・キルラタ（エトピリカ）
ウリア・アアルゲ・イノルナタ（ウミガラス） |
| （九） はと目 | |
| はと科 |
カルコファプス・インディカ・ヤマスィナイ（キンバト）
コルンバ・ヤンティナ・ニテンス（アカガシラカラスバト） |
| （一〇） ふくろう目 | |
| ふくろう科 | ケトゥパ・ブラキストニ・ブラキストニ（シマフクロウ） |
| （一一） きつつき目 | |
| きつつき科 |
デンドロコポス・レウコトス・オウストニ（オーストンオオアカゲラ）
ピコイデス・トリダクテュルス・イノウイエイ（ミユビゲラ） サフェオピポ・ノグキイ（ノグチゲラ） |
| （一二） すずめ目 | |
| やいろちょう | ピタ・ブラキュウラ・ニュンファ（ヤイロチョウ） |
| ひたき科 |
エリタクス・コマドリ・コマドリ（アカヒゲ）
エリタクス・コマドリ・ナミイエイ（ホントウアカヒゲ） エリタクス・コマドリ・スブルフス（ウスアカヒゲ） トゥルドゥス・ダウマ・アマミ（オオトラツグミ） メガルルス・プリュエリ・プリュエリ（オオセッカ） |
| みつすい科 | アパロプテロン・ファミリアレ・ハハスィマ（ハハジマメグロ） |
| あとり科 | カルドゥエリス・スィニカ・キトリトズィ（オガサワラカワラヒワ） |
| からす科 | ガルルルス・リドティ（ルリカケス） |
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備考
一 異名とは、種の名称以外の呼称で、分類学上一部で使用されているものをいう。 二 括弧内に記載する異名以外の呼称は、和名である。 |
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| 科名 | 種名 |
|---|---|
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第一 動物界
一 哺乳綱 食肉目 |
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| ねこ科 |
フェリス・エウプティルラ（ツシマヤマネコ）
フェリス・イリオモテンスィス（イリオモテヤマネコ） |
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二 爬虫綱
とかげ目 |
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| へび科 | オピストトロピス・キクザトイ（キクザトサワヘビ） |
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三 両生綱
さんしょううお目 |
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| さんしょううお科 | ヒュノピウス・アベイ（アベサンショウウオ） |
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四 魚上綱
こい目 |
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| こい科 |
アケイログナトゥス・ロンギピンニス（イタセンパラ）
タナキア・タナゴ（ミヤコタナゴ） |
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五 昆虫綱
とんぼ目 |
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| とんぼ科 | リベルルラ・アンゲリナ（ベッコウトンボ） |
| 第二 植物界 | |
| らん科 | キュプリペディウム・ムクラントゥム変種レブネンセ（レブンアツモリソウ） |
| はなしのぶ科 | ポレモニウム・キウスィアヌム（ハナシノブ） |
| きんぽうげ科 | カルリアンテムム・インスィグネ変種ホンドエンセ（キタダケソウ） |
| 備考 括弧内に記載する呼称は、和名である。 | |