Gracias a mis amigos: mia -representante del "lado oscuro" de la informática- :), Carola, Daniel, Txema que me ayudan como "betatesters" forzosos ;), y a todos los que me habéis escrito para advertirme de algún problema o mejora en el software que hago. También quiero agradecer a Silta (Juan, para los que le consideramos un amigo) y al equipo de faq-mac por publicar tan generosamente las notas que les envío.

English and Spanish dictionaries containing important cancer research terms.

What is new?

1. Updated the English and Spanish versions of the Dictionary of Cancer Terms. This update has been made by the NCI.
2. Added the pronunciation field that some of the online Dictionary of Cancer Terms records include.
3. Corrected some typos found in the Spanish version. This correction has been made by me. If you want to see the modifications introduced, please download the following PDF file (44 KB).

For more information, go to the following page.

Siempre resulta agradable ver que el trabajo que uno hace tiene su pequeño reconocimiento. Esta vez es Apple la que me ha dado esa satisfacción, al listar el Dictionary of Cancer Terms en sus páginas.

La sección de bioinformática de Madri+d, compromiso social con la Ciencia, se hace eco del Dictionary of Cancer Terms en este artículo.
La página de descarga del diccionario la tienes aquí.

José María Fernández González y José Manuel Rodríguez Carrasco, amigos y admirados compañeros de trabajo en el CNIO, nos explican en un interesante artículo publicado en weblog de Bioinformática de madri+d: qué son los widgets, la importancia que éstos tienen en el desarrollo de CARGO y, cómo se podrían implementar los nuevos widgets -gadgets para Google- de este proyecto bioinformático en iGoogle.

"Puntoycoma" -el boletín de los traductores españoles de las instituciones de la Unión Europea- publica en su número 108 una reseña de RAEútil (descarga directa del pdf -476 KB-)

Si quieres descargarte el programa, o simplemente tener más información de la aplicación, haz clic en este enlace.

English and Spanish dictionaries containing more than 5,500 important cancer research terms.

For more information, go to the following page.

Posiblemente ya sabrás que una de las 316 mejoras que ha incluido Apple en Leopard (Mac OS X 10.5.x) se refiere a la aplicación Diccionario. En esta aplicación, perfectamente integrada en el sistema operativo, se incluyen nuevos diccionarios.

Resulta gratamente sorprendente, y realmente útil, acceder al New Oxford American Dictionary, o a la Wikipedia [1]- entre otras obras- a través de este programa (Figura 1), el widget Dictionary (Figura 2) o, cualquier aplicación Cocoa como: Safari (Figura 3) o, el software de búsqueda Spotlight (Figura 4). Empecemos por la aplicación Diccionario:

Figura 1

¡Vale! ¡Genial! Pero: ¿qué pasa si necesito uno -pongamos por ejemplo el Diccionario de la Real Academia Española (DRAE), como podríamos pensar también en el Panhispánico- que no está incluido? ¿Sería posible añadirlo? ¿Qué pasos habría que dar para ello? Veámoslo a través del widget Dictionary:

Más información...

Nuevas características

1. El icono del Widget se actualiza con la palabra del día
2. Corrección de dos errores menores

La nueva versión el Widget de Yahoo! está disponible en su página principal.

Salvapantalla gratuito para Leopard (Mac OS X 10.5.x).
He creado Cuore para familiarizarme con el potente sistema gráfico que Apple incorpora en su sistema operativo, llamado Quartz.
Puedes descargártelo desde aquí.

La RAE ha puesto a disposición de sus usuarios las actualiaciones de sus productos informáticos para que sean funcionales en los nuevos sistemas operativos.



Para solicitar su descarga haga clic aquí

El neurólogo Woo-Hyun Cheon se hace eco de ProteinGlimpse 1.5. Siempre me resulta chocante que escriban sobre algo que he hecho; esta vez más, ya que está en coreano. ;)

ProteinGlimpse 1.5 is a Tiger and Leopard compatible free widget for visualizing macromolecules retrieved from the RCSB Protein Data Bank


New features:

1. Leopard compatible
2. Jmol 11.4.2 applet included

For more information, go to ProteinGlimpse Home Page

Nuevas características:

1. Opción para copiar texto (Mayús+Ctrl+C en Windows y Mayúsculas+Comando+C en Mac OS X)
2. Mensaje informativo en el menú desplegable de los diccionarios
3. Corregido el problema con la visualización incorrecta de la palabra del día

La nueva versión el Widget de Yahoo! está disponible en su página principal.

Corregido el problema que hacía que, en ocasiones, se quedara el widget permanentemente buscando.

La nueva versión el Widget de Yahoo! está disponible en su página principal.

Su nueva característica es la:

1. Implementación de una búsqueda rápida que permite hallar el significado de los lemas de la definición al hacer doble clic sobre ellos.

Este Widget se puede instalar en los sistemas operativos Windows Vista, Windows XP SP2, Windows 2000 SP4 y en Mac OSX 10.3.9 ó superior.

¿Qué hay de nuevo en esta versión?

1. Corregido el error que existía cuando el widget leía las preferencias establecidas por el usuario,
2. corregido el error en el aviso de actualización.

Disponible desde su página principal.

¿Qué hay de nuevo en esta versión?

1. Corregido el error que existía cuando el widget leía las preferencias establecidas por el usuario.

Disponible desde su página principal.

La nueva versión del Widget de Yahoo! está disponible desde su página principal.

Sus nuevas características son:

1. Controla el error, en el caso de no poder establecerse una conexión con los Diccionarios,
2. añade la palabra del día a las últimas búsquedas realizadas, en caso de que sea buscada desde su enlace directo.

RAEútil permite la búsqueda del significado de las palabra en el Diccionario de la Real Academia Española (DRAE) y en el Diccionario panhispánico de dudas (DPD).

RAEútil 0.9 es un Widget de Yahoo! que puede ser instalado bajo los siguientes sistemas operativos: Windows Vista, Windows XP SP2, 2000 SP4, Mac OSX 10.3.9 ó superior.

Más información:

• http://homepage.mac.com/eludens/raeutiles.html (ES)
• http://homepage.mac.com/eludens/raeutilen.html (EN)

Actualmente estoy trabajando, como pasatiempo, en una versión de RAEútil para Windows. He elegido, para ello, la plataforma gratuita de Yahoo! Widgets. En breve pondré la aplicación, en su fase beta, para que pueda ser descargada desde esta Web. ¡Mantente conectado! ;)

cNucleotides depicts, for a gene, the percentage of each nucleotide type in a pie chart fashion.

Use the export option to get extra data - as the gene sequence, the total number of nucleotides, the partial count for each nucleotide type, and the gene name - in a tabulated way.

It is a simple widget built to run on CARGO.



I will be fully functional in a couple of days. I hope... ;)

El widget "dictionary" para los que hablamos castellano. ;)


RAEútil permite la búsqueda del significado de las palabra en el Diccionario de la Real Academia Española (DRAE)- y en el Diccionario panhispánico de dudas (DPD). Ambos publicados por la Real Academia Española.


¿Qué hay nuevo en esta versión?

1 Se corrigen los errores relacionados con los botones de navegación y,
2 se establece como búsqueda por defecto a la de apoximación.

Puedes descargarte la versión 1.01 desde su página oficial en castellano o inglés.

ARRAYLEXPRESS (Microarray experiments linked with ArrayExpress database) is a widget for CARGO that connects between a gene and microarray-experiment IDs found in the ArrayExpress database. This widget uses a couple of ENFIN web services, [PICR (Protein Identificator Cross Reference) and ArrayExpress] to extract the information.

Note: due to the currently limited programmatic access to the ArrayExpress data warehouse, the functionality of this service is restriced to the retrieval of microarray experiment IDs until the new ArrayExpress version 2.0 is released and further data access allows the extension of this service.

REACT2me is a widget for CARGO that finds pathways from the Reactome database.
On entering a gene Ensembl identifier, the widget tries to map it to proteins found in Uniprot and get, for each one, all available pathways from the Reactome database.
REACT2me uses two ENFIN web services "in a row" [PICR (Protein Identificator Cross Reference) and Reactome] to obtain the required information.Más información...

A new release for this widget ready to run on CARGO.


New features

1. Excel export option added
2. Better error and cache management



EasternKegg v.1.1 as shown on CARGO.

I am glad to introduce a new a widget designed for CARGO called EasternKegg v. 1.0.
The aim of this mini-application is to help experimental biologists to get all known pathways found in KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) where a gene is involved.

I hope it will be available on our production server at CNIO soon.

Más información...

CARGO is updated! Try CARGO 2 a biomedical dashboard created by the Structural Biology and Biocomputing Group at the Spanish National Cancer Research Center.

There is a huge quantity of information generated in Life Sciences, and it is dispersed in many databases and repositories. Despite the broad availability of the information, there is a great demand for methods that are able to look for, gather and display distributed data in a standardized and friendly way.

CARGO (Cancer And Related Genes Online) is a configurable biological web portal designed as a tool to facilitate, integrate and visualize results from Internet resources, independently of their native format or access method. Through the use of small agents, called widgets, supported by a Rich Internet Application (RIA) paradigm based on AJAX, CARGO provides pieces of minimal, relevant and descriptive biological information. The tool is designed to be used by experimental biologists with no training in bioinformatics. In the current state, the system presents a list of human cancer genes.Más información...

Ya está disponible desde su página oficial, en castellano
y en inglés, la versión 1.0 de RAEútil.

Los requerimientos mínimos de sistema son:
Mac OS X 10.5.0 (Leopard) o superior y conexión a Internet.


Existe una versión de RAEútil, la 0.5, que es compatible con Tiger. La puedes encontrar en la página oficial.

¡Al fin! He resuelto los problemas de incompatibilidad de mi Web con las versiones de Internet Explorer 6 y 7, ó al menos eso parece cuando lo compruebo con IE instalado desde ies4osx ...

DraeÚtil pierde una "D" y gana en prestaciones. RAEútil, incluye un nuevo diccionario de la Real Academia Española, la palabra del día y, realiza una mejora sustancial en su interfaz.
Más información...

Last published paper:

MD Tabernero, AB Espinosa, A Maillo, O Rebelo, J Fernandez-Vera, JM Sayagues, M Merino, P Sousa, A Orfao.

Patient gender is associated with distinct patterns of chromosomal abnormalities and sex chromosome-linked gene expression profiles in meningiomas.

Oncologist. 2007 Oct;12(10):1225-36.

CARGO is a webserver for displaying biological information for human genes.

Have you tried CARGO? Give it a go at http://cargo.bioinfo.cnio.es/!

CARGO works best in Firefox.Más información...

Después de muchos años con el anterior interfaz, he actualizado- ¡por fin!- mi página Web personal. Espero que resulte más fácil, tanto su navegación, como su actualización. ;)

El acceso a la web anterior puede realizarse desde aquí.